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Benoît Serive

Benoît Serive

CV web Benoît Serive

Pharmacognosie marine
Océanographie
Biologie marine
Biotechnologie marine
37 ans
Permis de conduire
Freelance En simple veille
Lauréat du Prix de la vocation 2006

Lauréat 2013 Bourse Marie Curie IOF Programme OCEANCHArCoT

Membre du Réseau Francophone de Métabolomique et de Fluxomique

Membre de l'Association Francophone pour l'Enseignement et la Recherche en Pharmacognosie

Membre de l'American Society of Pharmacognosy

Membre de l'Association for the Sciences of Limnology and Oceanography

Reviewer pour les journaux
Marine Drugs et Algal Research

Invité au congrès Végétaux aquatiques : écologie et bénéfices (Porquerolles, octobre 2013)

Conférencier invité au 5ème Congrès International des Biotechnologies
(Valence, Espagne, Juin 2014)


En quelques mots :

Volontaire, passionné et sensible au respect des valeurs humaines, je souhaite mettre mes compétences au service de la recherche de molécules à haute valeur ajoutée issues de la biodiversité marine.


Domaine d'intérêt :

A l'interface entre l'océanographie biologique et la pharmacognosie marine


Palme d'or du superviseur érudit, bienveillant et intègre décernée à :

Prof. Ronald J. QUINN
(Griffith Institute for Drug Discovery, Brisbane, Australie)


Mentor inspirant :

Prof. émérite Jean-Michel KORNPROBST
(Université de Nantes)

Porteur de projet en biotechnologie marine

Société en cours de développement
Depuis juin 2018
  • Projet scientifique autour de la biodiversité marine et ses applications biotechnologiques
  • Proposer des solutions bio-inspirées des organismes marins pour améliorer la santé humaine
  • Programme OCEANCHArCoT : OCEAN CHemodiversity Against Cell cycle Targets
  • Développement d'une stratégie de déréplication de molécules de microalgues assistée par des outils de métabolomique
  • Exploration in silico des voies de signalisations touchées par des métabolites marins d'intérêt
  • Exploration du mode d'action de métabolites marins à l'aide de biotests, cytométrie en flux, microscopie à épifluorescence
  • Recherche de voies de valorisation de bioressources marines (dermo-cosmétique, nutraceutique et nutrition animale/aquacole)
  • Implication dans l'axe 7 du PIA OCEANOMICs: Innovation platform for plankton screening for active compounds and metabolites
  • Culture de lignées cellulaires tumorales et non tumorales
  • Programme OCEANCHArCoT : OCEAN CHemodiversity Against Cell Cycle Targets
  • Production de fractions marine optimisées "drug like"
  • Évaluation d'activité biologique de fractions issues d'organismes de le grande barrière de corail australienne
  • Déréplication de signatures RMN de fractions marines
  • Aim: Research of new marine inhibitors targeted against desease-relevant proteins kinases

    These latter are involved in various human pathologies such as cancer, neurodegenerative diseases or can be targeted to alter the life cycle of various parasites such as those responsible neglected parasitic diseases such as leishmaniasis and malaria. There are no physiological events not involving significant changes in protein phosphorylation. Therefore, PKs constitute currently the first class of targets used by pharmaceutical companies for the characterization of novel bioactive compounds. In a project intended to exploit the ocean biodiversity, Jean-Baptiste Charcot (1867-1936), a pioneer in oceanography established large collections of marine organisms. Taking this one step further, my project aims to source marine crude extracts from the Nature Bank collection (QLD, Australia), and from the unique Roscoff Culture Collection of microalgae (France) to identify new PK inhibitors. We will focus our analysis on PKs involved in the control of the cell division cycle (CDKs, TLKs and mitotic kinases such as Haspin and Auroras). The cellular effect of the selected inhibitors will be analysed on various cancer cell lines. This project will benefit from a new cutting edge technology will be used for the early screening of marine chemodiversity: bioaffinity (focused on PKs) mass spectrometry with a Bruker SolariX 12 Tesla FTMS. The lead-like enhanced fractions will be tested against various disease models and dereplicated in order to quickly identify bioactive molecules. Hit fractions will be produced in larger quantity before purification, characterization and pharmacological evaluation. In conclusion, OCEANCHArCoT will contribute, from Australia to France, to the research of marine bioactives to discover new therapeutic avenues to fight growing medical and social burdens such as cancer and Alzheimer’s disease.
  • Laboratoire dédié principalement aux applications biotechnologiques des microalgues ainsi qu'à l'étude de leur métabolisme
  • Recherche et production de métabolites d'intérêt en photochimiothérapie dynamique issus de micro-organismes photosynthétiques (travaux sous clauses de confidentialité)
  • Culture de microalgues et de cyanobactéries
  • Développement d'un biotest pour évaluer le potentiel d'intérêt visé en vue d'un criblage haut débit
  • Comparaison de méthodes de broyage cellulaire par la méthodologie des plans d'expériences
  • Optimisation d'extraction des molécules cibles
  • Développement de la déréplication des molécules cibles au moyen d'un couplage CLHP-UV DAD
  • Purification par chromatographie liquide haute performance
  • Analyse d'image
  • Cytométrie en flux
  • Valorisation de molécules par brevet en cours
  • Valorisation dans Bioresource Technology 124 : 311-320 (Serive et al, 2012)
  • Analyses pigmentaires de souches de Isochrysis afinis galbana pour l'équipe Algue & Génome du laboratoire PBA (IFREMER)
  • Comparaisons pigmentaires de souches de dinoflagellés pour le laboratoire de phycotoxines (IFREMER)
  • Étude pigmentaire d'un Glaucophyte
  • Composition pigmentaire de 45 souches de micro-organismes photosynthétiques
  • Laboratoire dédié à l'étude chimique des molécules marines d'intérêt
  • Extraction, purification, caractérisation de phospholipides et de stérols marins
  • Campagne de récolte de spongiaires, de cnidaires et d'échinodermes en plongée
  • Analyse et purification en chromatographie sur couche mince analytique et préparative
  • Purification en chromatographie liquide haute performance
  • Analyse par couplage chromatographie en phase gazeuse - spectrométrie de masse
  • Laboratoire dédié à la recherche d'activités biologiques à partir d'extraits marins
  • Mise au point de techniques de criblage d'activités biologiques
  • Culture de microalgues benthiques
  • Culture cellulaire (lignées cellulaires, bactéries, virus)
  • Tests anti-viraux
  • Tests anti-bactériens
  • Tests anti-fouling
  • Tests en cosmétologie (anti-radicaux libres, anti-élastase, anti-oxydant, anti-inflammatoires, cytotoxiçité)
  • Laboratoire dédié à l'étude des invertébrés d'intérêt aquacole
  • Recherche de méthodes alternatives à l'utilisation du chloramphénicol en élevage larvaire de coquille St Jacques (Pecten maximus)
  • Élevage larvaire de coquille St Jacques
  • Cultures de microalgues en continu et en batch
  • Techniques de microbiologie
  • Biotests en plaque de titration et en plaque de culture cellulaire
  • Analyse d'image
  • Embarquement pour évaluation des gisements de moule en vue de l’ouverture de la pêche aux pêcheurs professionnels dans le Nord Cotentin
  • Biométries
  • Enseignement et recherche en écologie des écosystèmes aquatiques mains, écologie animale et végétale, indicateurs biologiques, veille écologique
  • Collecte des échantillons sur l'estran
  • Détermination taxonomique
  • Analyses immunologiques de bivalves filtreurs
  • Transect

Ouvrier conchylicole

Entreprise ostréicole Billon J-Y
Septembre 1999 à mai 2001
Stage
Beauvoir sur Mer
France
  • Élevage d'huîtres creuses, vente sur les marchés
  • Étude technico-économique : Engraissement contrôlé de l'huître creuse Crassostrea gigas par la diatomée Skeletonema costatum
  • Stage longue durée par alternance (équivalent 15 mois temps plein)
  • Détrockage, marées, mise en poche, conditionnement, étude technico-économique du projet (dont faisabilité, prévisions comptables)
  • Co-culture de microalgues et de macroalgues en raceway (principalement Odontella aurita et Chondrus cripus)
  • Dénombrement de microalgues
  • Récolte et tri de la biomasse
  • Conditionnement de la pâte de microalgues
  • Rédaction du document de synthèse : La filière française des macroalgues
  • Collecte des échantillons sur le terrain
  • Tri des échantillons
  • Dénombrement et biométries
  • Participation à l’étude d’évaluation de la biomasse et de la densité de la coque Cerastoderma edule en élevage dans le traict du Croisic

Ouvrier mytilicole

Entreprise mytilicole Lamarche Y.
Septembre 1999 à décembre 1999
Stage
L'Aiguillon sur Mer
France
  • Élevage de moules de bouchots et sur filières
  • Tri des moules
  • Boudinage
  • Catinage
  • Conditionnement

Stagiaire biologiste

Aquarium marin de Saint Gilles Croix de Vie
Avril 1999 à mai 1999
Stage
Saint Gilles Croix de Vie
France
  • Aquarium marin public
  • Nourrissage des bacs
  • Nettoyage des aquariums
  • Préparation des rations
  • Visites guidées à 2 groupes scolaires
  • Élevage larvaire de turbots (module nurserie)
  • Tri manuel des turbots (selon taille et malformations)
  • Contrôle des paramètres des bassins
  • Préparation des rations de granulés
  • Nourrissage
  • Pêche des turbots
  • Élevage de naissaim d'huîtres creuses et de palourdes japonnaises
  • Tri du naissaim
  • Nourrissage en micronurserie
  • Lavage des tamis
  • Comptages
  • Conditionnement du naissaim

Ouvrier piscicole

Ferme marine des Etiers
Juillet 1998
Stage
Noirmoutier en l'Ile
France
  • Élevage de bars, daurades, turbots, gambas
  • Pêche à la senne
  • Nourrissage
  • Tri
  • Accueil des clients et vente directe
  • Désalguage des bassins

Ouvrier conchylicole par alternance

Entreprises ostréicoles diverses
Avril 1998 à juin 1999
Stage
Vendée
France
  • Entreprise Sachot G.
  • Entreprise Robin J-C.
  • Entreprise Lamarche S.
  • Entreprise Robard J-P.
  • Élevage larvaire et pré-grossissement de turbots (modules sevrage, nurserie et pré-grossissement)
  • Tri manuel des turbots (selon taille et malformations)
  • Tri mécanique des turbots (selon taille)
  • Vaccination des turbots par balnéation
  • Préparation des rations de granulés
  • Nourrissage
  • Pêche des turbots

Doctorat es Sciences, discipline Biomolécules, pharmacologie et thérapeutique

Ecole doctorale VENAM - Université de Nantes

Mars 2009 à décembre 2012
Thèse réalisée au Laboratoire de Physiologie et Biotechnologie des Algues - Centre IFREMER Nantes
Spécialité : Pharmacognosie marine et océanographie

Master Signalisation et Systèmes Intégrés en Biologie

Ecole Pratique des Hautes Etudes (EPHE)

Septembre 2006 à juillet 2008
Biologie cellulaire et moléculaire, cancérologie, cytométrie en flux, virologie

Master Mécanismes et optimisation de la bioproduction marine

Université de Nantes - UFR Sciences et Techniques

Septembre 2007 à juin 2008
Pharmacognosie marine, cultures marines, droit maritime, biologie marine

Licence Biochimie Biologie Moléculaire

Université Nantes - UFR Sciences et Techniques

Septembre 2004 à mars 2006
Enzymologie, biochimie, biologie moléculaire, chimie bio-organique, intégration des voies métaboliques
Projet de recherche tutoré : Optimisation du procédé d’immobilisation d’une beta-galactosidase issue de Bacillus circulans en vue de son exploitation en bioréacteur
Océanographie physique et biologique, zoologie marine, algologie, aquariologie, géologie marine, halieutique, aquaculture
Étude biblio-technique : Méthodes de récolte et de tri des œufs en pisciculture marine
Étude bibliographique : L'hydrothermalisme marin
Projet de recherche tutoré : Étude des conditions de maintien et de culture de macroalgues pour décorer un aquarium marin d’espèces locales

Remise à niveau scientifique

Université Catholique de l'Ouest - Institut de Mathématiques Appliquées

Septembre 2001 à juin 2002

Rédaction du document : Les microphytes marins

Brevet de Technicien Aquacole

Maison Familiale Rurale Les Plantes

Septembre 1999 à juillet 2001
Étude des techniques aquacoles, économie, comptabilité

BEP Maritime de Cultures Marines

Maison Familiale Rurale Les Plantes

Septembre 1997 à juillet 1999
Etude des techniques d'élevage et de culture des espèces marines, biologie marine
  • Analyses pigmentaires par CLHP-UV DAD
  • Extraction optimisée de micro-organismes photosynthétiques
  • Purification et culture de souches de microalgues
  • Purification de molécules naturelles marines
  • Développement de tests d'activités biologiques (anti-fouling, cosmétologie, pharmacologie)
  • Développement d'une stratégie de criblage d'activité pharmacologique
  • Collecte d'organismes marins en plongée pour études
  • Microscopie optique
    (dénombrement cellulaire et analyse d'image)
  • Culture cellulaire (lignées cellulaires humaines et animales, virus)
  • Bases de cytométrie en flux sur Accuri c6
  • Techniques de microbiologie de base (Isolement, culture, biotest)
  • Veille scientifique et technologique
    (base de brevets)
  • Études par plans expérimentaux
    (criblage de facteurs et optimisation)
  • Analyses statistiques des données
    (Statgraphics, Xlstat, Matlab)
  • Élaboration et gestion de projet (Diagramme de Gantt, Mind Mapping sur Mindmanager, devis, gestion des stocks)
  • Rédaction de cahier des charges
  • Reporting des résultats
  • Collaborations avec des laboratoires extérieurs (IFREMER Brest, LEMAR, CHU Nantes, Institut de Chimie de Nice, plateforme BIODIMAR Brest, Laboratoire de Phycotoxines Nantes)
  • Publications dans journaux à comité de lecture
  • Réseautage scientifique
  • Vulgarisation scientifique (Journée Mondiale des Océans, Square des Sciences, Fête de la Science, sortie estran)
  • Formation aux premiers secours
  • Permis de conduite des navires conchylicoles
  • Permis côtier
  • RIFA Plongée : Réactions et Intervention Face à un Accident subaquatique
  • Plongée sous-marine (N4 FFESSM)
  • Surf
  • Natation
  • Kayak
  • Tai-chi-chuan
  • Apnée
  • Sénégal
  • Allemagne
  • Écosse
  • Norvège
  • Australie
  • USA
  • Portugal
  • Fidji
  • Aquariophilie (10 ans)
  • Oenologie
  • Study on the microalgal pigments extraction process: performance of microwave-assisted extraction (2011) Process Biochemistry 46: 59-67
  • Antiproliferative activity of violaxanthin isolated from bioguided fractionation of Dunaliella tertiolecta extracts (2011) Marine Drugs 9: 819-831
  • Selection and optimisation of a method for efficient metabolites extraction from microalgae (2012) Bioresource Technology 124: 311-320
  • Screening marine resources to find novel chemical inhibitors of disease-relevant protein kinases (2015) Medecine/Sciences 31(5): 538-545
  • Community analysis of pigment patterns from 37 microalgae strains reveals new carotenoids and porphyrins characteristic of distinct strains and taxonomic groups (2017) PLoS One 12(2): 1-35
  • Constituents of Acacia nilotica (L.) Delile with novel kinase inhibitory activity (2017) Planta Medica International Open 4:108-113
  • Marine pigment diversity: applications and potential (2018) In: Blue Biotechnology: production and use of marine molecules
  • Microalgal biomass of industrial interest: methods of characterization (2019, in process) In: Biomass, waste and related by-products characterization